南京财经大学始建于1956年的粮食部南京粮食学校，是新中国自己创办的第一批粮食院校之一。1981年，南京粮食经济学院在原南京粮食学校的基础上建立。1993年，学校更名为南京经济学院。1999年，南京物资学校并入南京经济学院。2000年，南京经济学院、江苏财经高等专科学校、江苏经济管理干部学院三校合并，组建成新的南京经济学院。2003年，经教育部批准，学校正式更名为南京财经大学。2011年，江苏省人民政府与国家粮食局签约共建南京财经大学。2019年，国家粮食和物资储备局与江苏省人民政府签署战略合作协议，全力支持学校事业发展。

南京财经大学现已成为一所以经济管理类学科为主，经济学、管理学、法学、工学、理学、文学、艺术学等多学科支撑配套、协调发展的江苏省属重点建设大学。历经多年改革发展，学校知名度迅速扩大，教育质量不断提高，综合实力明显增强，社会声誉全面提升，各项事业迈上了新的台阶，显现出发展的强劲势头和改革的崭新气象。

学校拥有仙林、福建路和桥头3个校区，占地面积120.7万平方米，总建筑面积71.36万平方米。设有教学学院（部）18个。现有普通本科在校学生16000余人，在校博士、硕士研究生2600余人。拥有应用经济学博士后流动站，“现代粮食流通产业发展与政策”服务国家特殊需求博士人才培养项目，硕士学位授权一级学科12个，硕士专业学位授权点14个，本科专业49个。

学校坚持以学科建设为龙头，不断提升科学研究水平。学校现拥有应用经济学、工商管理、食品科学与工程等江苏高校优势学科3个，马克思主义理论、法学、统计学、数学、理论经济学、计算机科学与技术等江苏省重点（培育）学科6个。“农业科学”进入ESI国际学科排名全球前1%。获批现代服务业协同创新中心、现代粮食流通与安全协同创新中心、江苏现代财税治理协同创新中心等省级协同创新中心3个。