浙江工业大学生物工程学院前身为轻工业工程系，始建于1981年，是浙江省第一个和全国较早设立生物工程学科和专业的学院。学院历经轻工业工程系、生物与环境工程学院，2015年9月成立生物工程学院。现有生物工程和生物技术2个本科专业，生物工程一级学科硕士点，生物化工、微生物学、生物化学与分子生物学3个二级学科硕士点，生物与医药领域专业学位硕士点，生物化工博士点，已成为国内高水平生物工程专业技术人才凝聚地和培养中心，在国内外生物工程学术界和产业界享有较高的知名度和影响力。

浙江工业大学微生物学学位点依托生物工程学院生物工程一级学科。该学科入选浙江省“一流学科（A类）”建设计划和浙江省“重点高校建设计划”第一批重点建设学科，建有国家“2011计划”长三角绿色制药协同创新中心生物技术制药分中心等一批国家、省部级教学与科研平台。学位点以《微生物学》国家精品课程教学团队和浙江省首批重点创新团队——农业“生物三药”产业创新团队为核心，组建了一支结构合理、专业素质强的师资队伍。现有硕士生导师5人，均具有博士学位，其中国家“万人计划”科技创新领军人才1人。近年来，承担了多项国家自然科学基金和浙江省重大科技专项重点项目等重大课题项目，在Appl Environ Microbiol、Antimicrob Agents Chemother、Front Microbiol等国内外权威期刊发表学术论文100余篇，其中SCI收录的论文50余篇。

微生物学硕士点从1993年开始与本校相近专业联合招生，2003年批准为硕士学位授权点，2004年开始独立招生，已培养硕士毕业生150 余人，其中有省级优秀毕业生、全国“挑战杯”二等奖获得者等。

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