浙江工业大学生物工程学院前身为轻工业工程系，始建于1981年，是浙江省第一个和全国较早设立生物工程学科和专业的学院。学院历经轻工业工程系、生物与环境工程学院，2015年9月成立生物工程学院。现有生物工程和生物技术2个本科专业，生物工程一级学科硕士点，生物化工、微生物学、生物化学与分子生物学3个二级学科硕士点，生物与医药领域专业学位硕士点，生物化工博士点，已成为国内高水平生物工程专业技术人才凝聚地和培养中心，在国内外生物工程学术界和产业界享有较高的知名度和影响力。

浙江工业大学生物化工学科是浙江省首批重中之重学科，1998年获工学硕士授予权，2003年获工学博士授予权。2011年以生物工程学科滚动进入浙江省重中之重学科建设。2015年入选学校“浙江省重点高校建设计划”首批8个重点建设一级学科并被遴选为浙江省“一流学科”（A类）进行建设。学科建有手性生物制造国家地方联合工程研究中心、国家“2011计划”长三角绿色制药协同创新中心生物制药中心、国家化学原料药合成工程技术研究中心生物制药中心、生物转化与生物净化教育部工程研究中心、浙江省生物有机合成技术研究重点实验室等近10个国家和省部级科研平台。拥有一支有较高学术水平的学科队伍，其中中国工程院院士2人，教授26人，具有副高级专业技术职称教师23人，拥有国家“万人计划”科技创新领军人才2人，浙江省特聘专家、浙江省万人计划和浙江省杰出青年基金获得者等省级以上人才20余人。

近年来，学科承担了国家重点研发计划项目、国家973 计划项目、国家863计划项目、国家自然科学基金、国家新药创制重大专项、浙江省重大科技专项及重大科技开发校企合作项目等重大课题，获得国家技术发明二等奖、国家科技进步二等奖、浙江省科学技术一等奖、教育部科技进步一等奖、中国石油和化学工业联合会技术发明一等奖、中国专利优秀奖等多项奖励，在生物化工相关领域知名期刊发表学术论文300多篇。

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